食品药品检测体系中信息化技术存在不足主要表现在如下方面：
工作人员对信息化技术的重视程度不足
一个部门检测体系的好坏与工作人员的素质有着直接的关系，工作人员即使有专业的知识和丰富的经验，但没有对工作认真负责的态度，那么知识与经验也无用武之地。监管部门的一些基层工作人员由于工作繁忙，往往只用电脑录入或记录日常工作，不但没有形成用信息化系统管理的概念，反而认为多此一举，徒增工作量。
还有一些老员工观念守旧，不愿意接受新的事物，依旧沿用以前的工作流程。由于这些员工对于信息化技术重视程度不够，造成药品检测仪器、软件、硬件资源的极大浪费，不能充分发挥信息化的优势。
公开信息的准确性与时效性的不足
由于社会的不断进步，人们对于信息需求的数量与质量也不断提高。对于食品药品检测这一与人类生命安全息息相关的行业，人们更是希望可以及时得到准确的信息。虽然监管部门与政府对信息的公开化透明化正不断增强，但这些信息的准确性与时效性还达不到完美无缺。如果政务工作还做不到完全的公平、公开、公正，就 可能会招来监管相对人的投诉或者反诉，有时一些媒体也会起到推波助澜的作用，令简单的事态复杂化，这对政府工作带来了挑战。
信息资源之间的相互共享状况有待进一步提高
一个系统如果想高效稳定地运行，就需要各部门之间相互了解，这样各个部门才能更好地与其他部门合作，从而使整个系统高效稳定地前行。现阶段，监管系统各部门之间的资源共享环节还比较薄弱。由于每个部门都有各自的任务，有些信息还需要保密，所以每个部门为了完成自己的任务很少与其他部门交流或是分享资源，结果造成信息孤岛的现象。
还有，由于不同时间段外部环境不断的变化，导致各个部门会根据自身的状况做出相应调整，结果使得各个系统不能及时沟通，造成整个系统的运行出现障碍。所以，信息资源共享在一个系统之中是十分重要的，我们应该重视其发展，建立资源信息共享平台。
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